罗大纲吩咐留下三个团兵力的水师负责善后，继续寻找打捞落海的讨虏军将士和清军俘虏，归拢战船慢慢拖至南澳岛靠岸修理。
而他则和梁培友，各自率领近百艘大中型红单船，在虎门号等五艘西洋军舰的带领下，朝南澳岛方向，追击南澳总兵韩嘉谟。
廣东水师提督吴元猷和前提督洪名香双双战死，剩下清军将领不是被击毙，便是被俘虏。也只有南澳总兵韩嘉谟，能指挥剩下的清军水师了。
等众人赶到离南澳岛五里处，却见南澳岛上的最西端的深澳草寮尾主炮台和最东端的云澳炮台，两处烟尘滚滚。正疑惑间，两艘快哨船来报，南澳岛东北方3里许，发现了逃走的南澳总兵韩嘉谟船队。
见清军主力逃走，罗大纲便知道清军已彻底放弃南澳岛水师大营。于是，他留下四十余艘红单船的兵力负责清理炮台，他则和梁培友，各领八十艘红单战船，朝清军逃跑的水师全力追击。
而剩下的水师，派出两艘战船靠近两座炮台，出了滚滚浓烟，其他一丝一毫动静都没有。看来清军却是放弃了炮台。讨虏军不放心，又派出十余人登陆，爬至炮台上一看，清军早已全部撤走，将来不及运走的粮食和都甲衣等全部点燃。
接到信报后，讨虏军连忙全部登陆，纷纷浇水扑灭点燃的粮食，总算是抢救了几百石稻谷下来。
而这时的甲一师、甲三师，在林凤祥和陈玉成的率领下，轻松攻占惠来、普宁、揭阳等县城，已经将潮州府城团团包围。
在将近二万讨虏军的强大压力下，潮州府城的富户，竟然和城内的天地会众联合起来，向城外的讨虏军传出消息，说是要充当内应献城。正当林凤祥和陈玉成还在怀疑真假，疑虑之时，潮州府的知府竟然自尽身亡，潮州府城门被打开，城内数百天地会众和上百富户一道邀请讨虏军进城。
林凤祥和陈玉成这才知道原来城内的这些人是真的要投靠讨虏军，惊喜不已。一问得知，却原来潮州城内的大部分都是客家人，对满清的统治本就不大乐意，都还记住二百年前的那场屠杀了数万人的仇恨呢。
不过，对于富户，竟然也会投靠自己，林凤祥倒是很惊讶。他暂时也不知道如何处理。因此，他将此事让师参谋写了封急报，派人骑快马赶至广州，报告给圣王冯云山，由圣王定夺如何处置。
占领了潮州府城，林凤祥借用圣王的名义，传檄潮州府下面各县，要求各县限期5天内投降，而后，他让陈玉成坐镇府城，他自己亲领甲一师攻向澄海，打通与水师的联系，为水师提供补给地点。
澄海的防卫基本都面向韩江的入海口，澄海县令有心报效朝廷，准备发动城内城汛兵和民壮守城，但无奈清兵勇和城内的百姓早就听说廣州来的叛军的强大，都不愿替清廷卖命。无奈，澄海县令带领三十几名衙役和十余名家丁，在城楼来了两炮，便被谋反的衙役合伙抓住，开了城门押送到林凤祥面前。
而陈玉成，却也不愿干等着坐在潮州府城，他见清廷的各县城也没放多少守兵，便派出四个团，分为两组，攻向丰顺和饶平两县，顺便清扫乡间的零星溏汛兵。
其实也没什么溏汛兵了，得到讨虏军打来的消息，连县城的城防清军都四散奔逃，何况乡间的巡检司汛兵。
也才几天功夫，整个潮州府，除了最北边临近福键的大埔县，其余的全部被讨虏军占领。
罗大纲等率领水师追出近二十余里，又击沉了南澳总兵韩嘉谟的近十艘战船，见清军水师越逃越远，竟然朝远离海岸的苔湾方向而去，不得已，见天色快要暗下来，不得已，罗大纲命全体战船返回南澳岛。
当晚，罗大纲派人驾快船，向冯云山禀报南澳水师大捷的消息。次日，又接到林凤祥派人来邀请一干水师靠港，进入澄海城。
当下，审问俘虏，处理伤员，埋葬损失的七百多名水师将士，还有修理船只，补充粮食和弹药等，这些善后事宜，罗大纲亲自带着参谋部的人，忙碌起来。
五日后，罗大纲等人从愿意投降的清军水师中，挑选了部分属于潮州本地的身世贫苦之人子弟，补充进损失的讨虏军水师。
接着，继续沿海岸，朝福键境内出击。
由于，福键与廣东交界处的水师就是南澳镇水师，总兵韩嘉谟率领船队逃走后，周围再无水师来阻扰，很快，三天时间，甲五师和乙五师将福键境内的东山岛、诏安、云霄三地轻松占领。
而林凤祥和陈玉成的陆师，也从潮州府城出发，经饶平进入福键境内，攻占了大埔、永定和平和等地，并继续往前挺进，呈现包围漳州府城之势。
也是罗大纲他们大意，就在甲五师和乙五师进入南溪江，进攻漳浦城时，讨虏军留在南溪江口，浮头海湾处的二十余艘红单大船五十余艘红单小船，一共两个水师团的兵力，遭受到四支清军舰队的袭击。
原来，四天前，逃至金门岛的南澳总兵韩嘉谟，将粤贼水师进攻、南澳失守的情况禀报给正在金门镇视察的福键水师提督施得高。
施得高一听大惊，忙问如何驱逐贼军。
还是韩嘉谟出主意。他得知粤贼水师总是将沿岸的县城一一攻克，因此，便将主意打至漳浦。
韩嘉谟向水师提督施得高建议，调集金门、苔湾两镇水师，加上他提标本标5营，以及韩嘉谟剩下的五十余艘战船二千余人，四路舰队合击粤贼水师，必能大胜。而且，韩嘉谟继续出着主意，他们准备趁讨虏军水师进入内河攻克县城之际，将外面防守的少量战船歼灭，然后快速地在河口处埋伏。
福键水师提督施得高大喜，连忙连夜调集苔湾、金门两镇水师和本标水师，浩浩荡荡杀到浮头湾。
浮头湾的近八十艘红单战船，拱卫着海湾，看见清军水师攻来，一边派人向内河上的罗大纲等人禀报，一边摆开阵型，守住入海口，向清军水师开炮。
清军的福键的水师整体实力比廣东水师差了较多，船上火炮不足，装备的大多还是雍正年间配备的小炮和排枪。
苔湾和金门两镇水师，各有嘉庆年间留下来的大型赶缯船十余艘，每艘船上设清兵80名，有排枪40支，中小型火炮数门，并且，船上清兵将近一半配有鸟枪、火箭等物。两镇水师主要战船还是同安梭船类型，船体呈梭形，航速较快，但体积变小，每艘船上火炮不足8门，排枪20支。
一开始，红单战船还占很大优势，上二三百发炮弹射向冲入海湾的福键水师，顿时，冲在最前面的金门镇水师便被击沉三艘赶缯船和一艘同安梭船。而金门镇水师船队一番还击，却并未怎么伤到讨虏军的红单战船。
不过，随着第二轮开火之后，苔湾镇水师、施得高提标水师以及韩嘉谟水师靠近，红单战船开始被团团围住。
留守的二名团长见势不妙，但却不敢自行逃离。因为一旦逃走，河口被敌军占据，在内河上的水师便会被包了饺子，被清军水师封锁起来，有全军覆没的危险。
因此，只能撑到己方主力赶到，出了河口才行。
八十艘红单战船，在两名团长的指挥下，退守河口处，排成两排，与清军水师对轰。
几轮炮击下来，清军冲在最前面的金门镇水师和苔湾镇水师被击沉近七艘赶缯船和五艘同安梭船，而同时，讨虏军水师的红单战船也被击沉了2艘。而且，随着清军水师的逼近，前面一排的水师已经不得不与清军开展接舷战了。
这时，清军的大型同安梭船上的排枪开始发威了，数百杆排枪同时开火，讨虏军这边的红单船上木屑四飞，许多船上的将士被打成筛子，血光四溅，幸好，烟雾让清军看不大清楚，只是朝对面方向胡乱开枪。
但讨虏军将士已不敢露头。只得死守河口，硬顶住清军的火力压制。因烟雾弥漫，无法看清外部，只得自行判断调整火炮角度，朝清军方向猛轰。
但紧接着，清军猛冒着炮火，猛扑过来，接舷战一发生，前排红单船上的水师便无法再进行炮击，被迫与登上船来的清军兵勇开展近战。火炮手们手持鸟枪和牌刀，守住舱门，攻击着进舱的清军兵勇。
但随着清军士兵的越来越多，特别是大量鸟枪手的几番轮射，前排红单船将士死伤惨重。
不得已，讨虏军团长下令放弃前排红单战船，将前排战船全部点火焚烧，借着火势阻止清军。
一时间熊熊大火，满布整个河口，连带着船舱的火药爆炸，将船上未来得及跳水的清军和讨虏军一同炸的四分五裂。
见讨虏军如此决绝和英勇，清军吓退了，连连后撤，等待燃烧的战船熄灭。
但，只要火一熄灭，清军便要继续扑上来，河口将难以守住。
正在这时，紧紧守住河口，陷入绝望的近二千将士，听到了背后熟悉的战鼓声和轰轰的蒸汽机发动声。是铁牛号率先赶到了。
讨虏军水师主力终于返回。